Які файли поперекового, шийного та грудного відділів хребта тут відкриваються
Дослідження хребта рідко надходить як одна охайна папка — МРТ поперекового відділу часто виглядає як чотири-п'ять коротких аксіальних серій, скріплених із сагітальною серією, серія при сколіозі — це один повнорозмірний знімок, а контрольна КТ після спондилодезу — щільний ізотропний об'єм, побудований для фіксатора. Ця сторінка розповідає, як насправді виглядає кожен із цих варіантів, потрапивши в переглядач, тож ви ще до завантаження знатимете, чи відкриється ваш диск, ZIP із порталу чи лікарняний диск акуратно.
Формати архівів
Якщо ваш знімок надійшов у вигляді одного великого стисненого файлу, перетягніть його безпосередньо у переглядач — ми розпакуємо його у вашому браузері.
- ZIP — найпоширеніший формат на дисках лікарень та у завантаженнях із порталів пацієнтів
- TAR — поширений формат для наукових наборів даних
- .tar.gz та .tgz — стиснення TAR + GZIP
Синтаксиси передачі DICOM
Технічний формат, що використовується для кодування піксельних даних у файлі DICOM. Наш переглядач декодує кожний поширений синтаксис передачі, що використовується клінічними сканерами.
- Implicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2)
- Explicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2.1)
- JPEG без втрат (1.2.840.10008.1.2.4.70)
- JPEG Extended 12-bit (використовується стоматологічним КПКТ i-CAT)
- RLE Lossless
- 8-бітні, 12-бітні та 16-бітні піксельні дані
- Фотометричні інтерпретації MONOCHROME1 і MONOCHROME2
NIfTI (наукові / конвертовані знімки)
NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) — формат, що використовується більшістю дослідницьких та постобробних інструментів. Якщо ваш знімок проходив через конвеєр, як-от FreeSurfer або fastMRI, ймовірно, у вас є файл NIfTI.
- .nii — нестиснений NIfTI-том
- .nii.gz — NIfTI, стиснутий GZIP (найпоширеніший)
Що зазвичай містить дослідження хребта
Протоколи МРТ поперекового, шийного та грудного відділів мають подібну структуру: сагітальна T1-серія для кісткового мозку та висоти диска, сагітальна T2-серія для гідратації й стенозу, а STIR — коли є підозра на перелом чи набряк, оскільки STIR пригнічує сигнал жиру й робить кістковий забій чи гострий компресійний перелом чітко видимими. Поверх цієї сагітальної основи зазвичай розташована окрема аксіальна серія на рівень чи пару рівнів, нахилена відповідно до кута кожного диска, а не спрямована прямо через увесь хребет.
Серії рентгенів хребта виглядають зовсім по-іншому. Стандартна серія поперекового чи шийного відділу — це стояча пара прямого й бічного знімків; обстеження на нестабільність додає бічні знімки у флексії та екстензії, зроблені при нахилі пацієнта вперед і прогині назад, щоб хірург міг побачити, наскільки сегмент зісковзує між положеннями. Клініки сколіозу знімають повнорозмірні стоячі плівки, що фіксують увесь хребет за одну експозицію чи як зшитий набір панелей із перекриттям, тож усе викривлення можна виміряти на одному зображенні.
КТ хребта охоплює третю групу питань — дефекти міжсуглобової частини дуги, положення фіксатора спондилодезу та лінії переломів, які МРТ може недооцінити в щільній кістці. Коли пацієнту не можна робити МРТ — через кардіостимулятор чи несумісний імплант, — КТ-мієлографія замінює це контрастом, введеним у спинномозковий канал і знятим на КТ замість МРТ, щоб показати компресію нервового корінця без магнітного поля.
Як насправді надходять файли
На практиці папка з МРТ поперекового відділу з лікарняного диска містить чотири-п'ять коротких аксіальних серій — кожна охоплює лише два-три рівні диска — поруч із сагітальними T1 і T2 серіями та файлом-індексом DICOMDIR у корені диска. Скринінгове дослідження всього хребта повторює той самий патерн тричі, по одному разу на сегмент. Завантаження з пацієнтського порталу зазвичай надходять як один ZIP, що обгортає ту саму структуру папок. EOS та інші системи повнорозмірної рентгенографії експортують одне високе зшите зображення, а не набір невеликих панелей, а дослідницькі експорти, перетворені через конвеєри на кшталт FreeSurfer, зазвичай мають вигляд об'ємів .nii чи .nii.gz замість необробленого DICOM.
Товщина зрізу і чому 3D хребта поводиться інакше
Нахилені по кожному диску аксіальні серії, поширені в МРТ поперекового й шийного відділів, — це причина, чому об'єми хребта важче реконструювати, ніж МРТ коліна чи плеча: кожна серія охоплює лише два-три рівні й нахилена в іншу площину, ніж сусідня, тому переглядач не може об'єднати їх в один суцільний 3D-об'єм — кожну нахилену серію ви переглядаєте окремо. Сагітальні серії, отримані з товщиною зрізу 3–4 мм, обмежують об'ємний рендеринг уздовж довжини хребта, хоча вони чудово читаються зріз за зрізом. КТ хребта — виняток: її зазвичай реконструюють як тонкий ізотропний об'єм, і саме тому хірурги замовляють КТ, а не МРТ, коли їм потрібна справжня 3D-модель для планування фіксатора. Один бічний знімок чи знімок у флексії-екстензії, тим часом, залишається плоским 2D-зображенням незалежно від способу зйомки — з однієї експозиції об'єм не побудувати.
Сумісність за одним поглядом
| Формат | Відкривається у переглядачі | 3D / MPR | Примітки |
|---|---|---|---|
| DICOM (.dcm / .dicom / .ima) | Так | Лише по серіях — нахилені диски не об'єднуються в один об'єм | Рідний вивід сканера |
| ZIP / TAR / .tar.gz | Так | Залежить від DICOM-серій усередині | Поширено для завантажень із порталу для повного дослідження хребта |
| NIfTI (.nii / .nii.gz) | Так | Так, якщо експортовано як один суцільний об'єм | Експорти дослідницьких конвеєрів |
DICOM (.dcm / .dicom / .ima)
Відкривається: так · 3D: лише по серіях · Рідний вивід сканера
ZIP / TAR / .tar.gz
Відкривається: так · 3D: залежить від вмісту · Типове завантаження з порталу
NIfTI (.nii / .nii.gz)
Відкривається: так · 3D: так, як один об'єм · Дослідницький експорт
Приватність і перегляд багатосерійного дослідження хребта
Оскільки дослідження поперекового чи шийного відділу може бути розділене на півдюжини невеликих серій, виникає спокуса завантажити кожну окремо в різні місця для перевірки — не робіть цього. Усе тут декодується й рендериться локально у вашому браузері, тож завантажити всю папку одразу — це водночас найпростіший і найбільш приватний спосіб переглянути сегментоване дослідження хребта; жодна серія нікуди не надсилається для повторного складання.
Коли файл хребта не відкривається
Дві найпоширеніші проблеми, специфічні для хребта: дослідження, розділене на кілька аксіальних стеків під різним кутом, які пацієнт вважає такими, що мають об'єднатися в один прокручуваний об'єм — цього не станеться, бо кожен стек призначався під власним кутом, і це очікувана поведінка, а не помилка завантаження. Друга — сильний штриховий артефакт навколо педикулярних гвинтів і стрижнів на КТ після спондилодезу, який виникає через розсіювання рентгенівського променя самим металом під час первинного сканування і не може бути усунений заднім числом. Поза цими двома випадками зашифрований диск або пропрієтарний експорт поза підтримуваним переліком трапляється рідко; якщо таке станеться, попросіть у Вашого діагностичного центру стандартний DICOM-експорт. Якщо після завантаження папки скринінгового дослідження всього хребта здається, що бракує сегмента, перевірте, чи скопійовано з диска всі підпапки шийного, грудного та поперекового досліджень — лікарні іноді розбивають замовлення на весь хребет на три окремі папки досліджень замість однієї об'єднаної.
Часті запитання
Чому в моєму МРТ поперекового відділу п'ять окремих стеків замість одного?
Більшість поперекових протоколів передбачають окрему аксіальну серію, нахилену паралельно кожному міжхребцевому простору, а не один суцільний об'єм через увесь сегмент, бо одна пряма наскрізна серія перетинала б кожен диск під кутом і розмивала б саме ту площину, яка потрібна радіологу. Це нормально — завантажте всю папку, і переглядач збереже кожну нахилену серію як окрему, а не примусово об'єднає їх в один об'єм.
Чи може переглядач відкрити рентгени у флексії та екстензії разом?
Так. Знімки в згинанні, розгинанні та нейтральному бічному положенні зазвичай експортуються як три окремі DICOM-зображення з одного дослідження. Додайте їх разом, і переглядач покаже кожне положення поруч, щоб Ви могли порівняти, наскільки зміщуються хребці між знімками.
Чи відкривається дослідження всього хребта при сколіозі так само?
Повнорозмірні стоячі знімки знімають або як одне зшите зображення, або як невеликий набір панелей із перекриттям, які сканер об'єднує автоматично. Обидва варіанти відкриваються як стандартне DICOM-зображення — тут немає 3D-реконструкції, яку потрібно будувати, оскільки звичайна плівка залишається двовимірною, незалежно від висоти знімка.
Який типовий розмір завантаження МРТ поперекового чи шийного відділу?
Звичайна МРТ поперекового чи шийного відділу із сагітальними T1, сагітальними T2, STIR та кількома аксіальними серіями під кутом зазвичай важить від 40 до 250 МБ. Скринінгова МРТ усього хребта чи мієлографія із серіями контрастної фази можуть значно перевищувати цей обсяг — переглядач потокує великі дослідження зріз за зрізом, а не завантажує все в пам'ять одразу.
Чи відкриється хребет після спондилодезу з педикулярними гвинтами й стрижнями?
Так. Дані пікселів DICOM навколо титанових конструкцій відкриваються нормально, хоча зрізи КТ біля гвинта чи стрижня часто показують променистий штриховий артефакт, який може приховати точну межу кістка-конструкція. Це обмеження вихідного КТ-сканування, а не те, що вносить переглядач.
Мій диск хребта запускає лише переглядач Windows — що робити?
Пропустіть вбудований запускач диска й відкрийте натомість файловий провідник. Під виконуваним файлом ховається звичайна папка DICOM, зазвичай названа DICOM або з файлом-індексом DICOMDIR у корені, — скопіюйте цю папку на свій комп'ютер і перетягніть її прямо в наш переглядач, який читає ті самі файли без потреби у Windows.
