Quali file della colonna lombare, cervicale e toracica si aprono qui
L'imaging della colonna raramente arriva come un'unica cartella pulita: una RMN lombare si presenta spesso come quattro o cinque brevi sequenze assiali unite a una serie sagittale, una serie per scoliosi è un'unica lastra a figura intera, e una TC di follow-up per fusione è un denso volume isotropico costruito per gli impianti. Questa pagina illustra come si presenta davvero ciascuno di questi casi una volta caricato nel visualizzatore, così saprà già prima di caricare se il suo disco, ZIP da portale o CD ospedaliero si aprirà correttamente.
Formati archivio
Se la scansione è arrivata come un unico file compresso, trascinarlo direttamente nel visualizzatore — verrà decompresso nel browser.
- ZIP — il formato più comune su CD ospedalieri e download dal portale pazienti
- TAR — comune per i dataset di ricerca
- .tar.gz e .tgz — compressi TAR + GZIP
Sintassi di trasferimento DICOM
Il formato tecnico utilizzato per codificare i dati pixel all'interno di un file DICOM. Il nostro visualizzatore decodifica tutte le transfer syntax comuni utilizzate dagli scanner clinici.
- Implicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2)
- Explicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2.1)
- JPEG Lossless (1.2.840.10008.1.2.4.70)
- JPEG Extended a 12 bit (usato da i-CAT dental CBCT)
- RLE Lossless
- Dati pixel a 8, 12 e 16 bit
- Interpretazioni fotometriche MONOCHROME1 e MONOCHROME2
NIfTI (ricerca / scansioni convertite)
NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) è il formato utilizzato dalla maggior parte degli strumenti di ricerca e post-elaborazione. Se la scansione è stata elaborata attraverso una pipeline come FreeSurfer o fastMRI, probabilmente si dispone di un file NIfTI.
- .nii — volume NIfTI non compresso
- .nii.gz — NIfTI compresso con GZIP (il più comune)
Cosa contiene di solito uno studio della colonna
I protocolli di RMN lombare, cervicale e toracica condividono uno schema simile: una sequenza T1 sagittale per midollo osseo e altezza discale, una sequenza T2 sagittale per idratazione e stenosi, e una STIR quando si sospetta una frattura o un edema, poiché la STIR sopprime il segnale del grasso e rende chiaramente visibile una contusione ossea o una frattura da compressione acuta. Sovrapposta a questa struttura sagittale c'è di solito una sequenza assiale separata per livello o per coppia di livelli, angolata per seguire l'inclinazione di ogni disco anziché procedere dritta lungo la colonna.
Le serie radiografiche della colonna hanno un aspetto diverso. Una serie lombare o cervicale standard è una coppia AP e laterale in piedi; un accertamento per instabilità aggiunge proiezioni laterali in flessione ed estensione acquisite con il paziente che si piega in avanti e si inarca all'indietro, così un chirurgo può vedere quanto un segmento scivola tra le posizioni. Gli ambulatori di scoliosi eseguono lastre a figura intera in piedi che catturano l'intera colonna in un'unica esposizione o come un insieme assemblato di pannelli sovrapposti, così l'intera curva può essere misurata su un'unica immagine.
La TC della colonna copre un terzo insieme di domande completamente diverso: difetti della pars interarticularis, posizione degli impianti di fusione e linee di frattura che la RMN può sottostimare nell'osso denso. Quando un paziente non può sottoporsi a RMN, un pacemaker o un impianto incompatibile, una mielografia TC sostituisce con mezzo di contrasto iniettato nel canale spinale, ripreso con la TC anziché con campi magnetici, per mostrare la compressione della radice nervosa.
Come arrivano davvero i file
In pratica, una cartella di RMN lombare da un CD ospedaliero contiene quattro o cinque brevi sequenze assiali, ciascuna che copre solo due o tre livelli discali, accanto alle serie sagittali T1 e T2 e a un file indice DICOMDIR alla radice del disco. Uno studio di screening dell'intera colonna raggruppa lo stesso schema tre volte, una per segmento. I download da portale paziente arrivano di solito come un unico ZIP che racchiude la stessa struttura di cartelle. I sistemi EOS e altri sistemi radiografici a figura intera esportano un'unica immagine alta assemblata anziché una serie di piccoli pannelli, e le esportazioni di ricerca convertite tramite pipeline in stile FreeSurfer arrivano tipicamente come volumi .nii o .nii.gz anziché DICOM grezzo.
Spessore delle sezioni e perché il 3D della colonna si comporta diversamente
Le sequenze assiali angolate per singolo disco, comuni nella RMN lombare e cervicale, sono il motivo per cui i volumi della colonna sono più difficili da ricostruire rispetto a una RMN di ginocchio o spalla: ogni sequenza copre solo due o tre livelli ed è inclinata su un piano diverso rispetto a quella adiacente, quindi il visualizzatore non può unirle in un unico volume 3D continuo: ogni sequenza angolata viene esaminata singolarmente. Le sequenze sagittali acquisite con uno spessore di sezione di 3-4 mm limitano il rendering volumetrico lungo la lunghezza della colonna anche se si leggono perfettamente bene sezione per sezione. La TC della colonna è l'eccezione: viene di solito ricostruita come un volume sottile e isotropico, ed è esattamente per questo che i chirurghi richiedono la TC anziché la RMN quando serve un vero modello 3D per la pianificazione degli impianti. Una singola radiografia laterale o in flessione-estensione, invece, resta un'immagine 2D piatta indipendentemente da come è stata acquisita: non c'è alcun volume da costruire a partire da una singola esposizione.
Compatibilità in sintesi
| Formato | Apre nel visualizzatore | 3D / MPR | Note |
|---|---|---|---|
| DICOM (.dcm / .dicom / .ima) | Sì | Solo per sequenza: i dischi angolati non si uniscono in un unico volume | Output nativo dello scanner |
| ZIP / TAR / .tar.gz | Sì | Dipende dalle sequenze DICOM contenute | Comune nei download da portale di uno studio completo della colonna |
| NIfTI (.nii / .nii.gz) | Sì | Sì, quando esportata come un unico volume continuo | Esportazioni da pipeline di ricerca |
DICOM (.dcm / .dicom / .ima)
Apertura: sì · 3D: solo per sequenza · Output nativo dello scanner
ZIP / TAR / .tar.gz
Apertura: sì · 3D: dipende dal contenuto · Download tipico da portale
NIfTI (.nii / .nii.gz)
Apertura: sì · 3D: sì, come volume unico · Esportazione di ricerca
Privacy e visualizzazione di uno studio della colonna multi-sequenza
Poiché uno studio lombare o cervicale può essere suddiviso in una decina di piccole sequenze, si è tentati di caricarne ognuna separatamente per verificarla: non lo faccia. Tutto qui viene decodificato e renderizzato localmente nel suo browser, quindi caricare l'intera cartella in una sola volta è sia il modo più semplice sia il più privato per esaminare uno studio segmentato della colonna; nessuna sequenza viene inviata altrove per essere ricomposta.
Quando un file della colonna non si apre
I due inconvenienti specifici della colonna che vediamo più spesso: uno studio suddiviso in diverse sequenze assiali angolate che un paziente presume debbano combinarsi in un unico volume scorrevole, non lo faranno, perché ogni sequenza è stata prescritta con un proprio angolo, e questo è un comportamento previsto, non un caricamento difettoso. L'altro è un forte artefatto a striature intorno a viti e barre peduncolari su una TC post-fusione, che deriva dal metallo stesso che diffonde il fascio di raggi X durante la scansione originale e non può essere rimosso a posteriori. Al di fuori di questi due casi, un disco crittografato o un'esportazione proprietaria fuori dall'elenco supportato è raro; chieda al suo centro di imaging un'esportazione DICOM standard se si presenta uno di questi casi. Se uno studio di screening dell'intera colonna sembra mancante di un segmento dopo aver caricato la cartella, verifichi che ogni sottocartella delle acquisizioni cervicale, toracica e lombare sia stata copiata dal disco: gli ospedali a volte suddividono un ordine per l'intera colonna in tre cartelle di esame separate anziché in un unico studio combinato.
Domande frequenti
Perché la mia RMN lombare ha cinque sequenze separate invece di una sola?
La maggior parte dei protocolli lombari prescrive una nuova sequenza assiale angolata parallelamente a ogni spazio discale anziché un unico volume continuo lungo l'intero segmento, perché una singola sequenza continua taglierebbe obliquamente ogni disco e sfocherebbe il piano esatto di cui un radiologo ha bisogno. È normale: carichi l'intera cartella e il visualizzatore mantiene ogni sequenza angolata come serie a sé stante anziché forzarle in un unico volume.
Il visualizzatore può aprire insieme le radiografie in flessione ed estensione?
Sì. Le lastre in flessione, estensione e laterale neutra vengono di solito esportate come tre immagini DICOM separate dallo stesso studio. Le carichi insieme e il visualizzatore elenca ogni posizione affiancata così può confrontare quanto le vertebre si spostano tra le proiezioni.
Uno studio per scoliosi a colonna intera si apre allo stesso modo?
Le lastre a figura intera in piedi vengono acquisite come un'unica immagine assemblata o come un piccolo insieme di pannelli sovrapposti che lo scanner unisce automaticamente. In entrambi i casi si apre come un'immagine DICOM standard: non c'è alcuna ricostruzione 3D da costruire, poiché una radiografia semplice resta bidimensionale indipendentemente da quanto sia alta l'esposizione.
Quanto è grande in genere il download di una RMN lombare o cervicale?
Una RMN lombare o cervicale di routine con T1 sagittale, T2 sagittale, STIR e diverse sequenze assiali angolate si colloca di solito tra 40 e 250 MB. Uno screening RMN dell'intera colonna o una mielografia con serie in fase di contrasto possono superare ampiamente questo valore: il visualizzatore trasmette in streaming gli studi di grandi dimensioni sezione per sezione anziché caricare tutto in memoria contemporaneamente.
Una colonna post-fusione con viti e barre peduncolari si aprirà comunque?
Sì. I dati dei pixel DICOM intorno agli impianti in titanio si aprono normalmente, sebbene le sezioni TC a contatto con una vite o una barra mostrino spesso un artefatto a stella con striature che può oscurare l'esatta interfaccia osso-impianto. È un limite dell'acquisizione TC originale, non qualcosa introdotto dal visualizzatore.
Il mio CD della colonna avvia solo un visualizzatore Windows: e adesso?
Salti il programma di avvio incluso nel disco e apra invece il browser dei file. Sotto l'eseguibile c'è una semplice cartella DICOM, di solito chiamata DICOM o con un file indice DICOMDIR alla radice: copi quella cartella sul suo computer e la trascini direttamente nel nostro visualizzatore, che legge gli stessi file senza bisogno di Windows.